Die Baustoff Union GmbH & Co. KG ist 1974 aus einer Fusion von drei Münchner Baustoffhandelsfirmen hervorgegangen. Die Vorläuferfirmen waren in und um München zum Teil bereits seit 1924 tätig. Im Jahr 1976 wurde ein weiteres Baustoffhandelsunternehmen am östlichen Münchner Stadtrand von der Baustoff Union übernommen.
Im Jahr 1979 erfolgte eine erste Neuordnung der Gesellschafterverhältnisse.
Heute ist die Baustoff Union GmbH & Co. KG eine 90 %-ige Tochter der Bauzentrum Mayer GmbH & Co. KG, Ingolstadt.
1982 erweiterte die Baustoff Union ihren Aktionsradius in den Landkreis Ebersberg durch Übernahme einer ehemaligen Filiale eines ansässigen Baustoffhändlers.
Weitere Expansionen und Firmenübernahmen, insbesondere aber die Erweiterung um die Sortimente Fliese und Bauelemente, machten es notwendig, für das Unternehmen einen zentralen großen Standort zu schaffen. Dieses als Bauzentrum neu konzipierte Gebäude an der Wasserburger Landstraße 133 wurde am 25.03.1983 mit angegliedertem hagebaumarkt eröffnet. Im Jahr 1991 wurde in der ca. 30 km östlich von München liegenden Stadt Grafing die Baustoffhandelsfiliale neu eröffnet und gleichzeitig ein ca. 1.000 qm großer hagebaumarkt eingerichtet.
Seit 1995 präsentiert sich das Unternehmen im Bereich des Fachhandels mit vier Standorten, wobei zu dem bestehenden Standort an der Wasserburger Landstraße in München und in Grafing noch der Fachstandort für Trocken-, Innenausbau und Putzsysteme an der Reitknechtstrasse sowie das Logistik- und Verwaltungszentrum der Baustoff Union in Hohenbrunn am südöstlichen Stadtrand von München hinzukamen.
Die Baustoff Union bedient das gesamte Spektrum des Bauens und Renovierens mit Ausnahme der Gewerke Haustechnik und Elektro.
Die Entwicklung des Einzelhandels in Form von hagebaumärkten der Baustoff Union verlief insbesondere in den Jahren 2004 bis 2008 sehr expansiv, so daß heute, zumeist als eigenständige Tochtergesellschaften, sechs hagebaumärkte betrieben werden, drei davon als großflächige Märkte mit Gartencenter, zwei Märkte mittlerer Größenordnung und ein Lokalversorger.
Die Baustoff Union Gruppe beschäftigt (incl. aller Tochtergesellschaften) ca. 300 Mitarbeiter.